Исследователи из Института Висса при Гарвардском университете, Бостонской детской больницы и Гарвардской медицинской школы разработали платформу FIND. Она ищет молекулы, способные менять взаимодействие между двумя белками. О результатах 5 ноября 2026 года сообщил Гарвардский университет. Работа опубликована в журнале Science, DOI: 10.1126/science.adt7185.

Обычный скрининг спрашивает, прикрепилась ли молекула к белку. FIND проверяет, изменила ли она работу белковой пары. В библиотеке из 400 млн малых молекул исследователи нашли соединения, усиливавшие взаимодействие белка PPAR-гамма с фрагментом его партнёра CBP. В культивируемых клетках эти соединения также увеличивали накопление липидов, что соответствовало активации PPAR-гамма.

Как FIND видит изменение взаимодействия

Белки нередко работают в связке с другими белками. Поэтому прочное связывание молекулы с одной мишенью ещё не говорит о полезном эффекте. В некоторых случаях решающим оказывается другое: собралась ли нужная белковая пара и какой сигнал она после этого передала.

FIND использует программируемые ДНК-нанопереключатели. К одной молекуле ДНК прикрепляют две потенциально взаимодействующие белковые части. Пока они не связались, конструкция остаётся вытянутой. Когда белки сближаются, они подтягивают друг к другу два участка ДНК, и переключатель складывается в петлю.

Тестируемую молекулу и нуклеотидный штрихкод, который её идентифицирует, прикрепляют к тому же переключателю. Линейные и петлевидные конструкции разделяют электрофорезом: петли движутся по гелю медленнее. Затем исследователи считывают штрихкоды и определяют, какие молекулы увеличили долю нужных, петлевидных форм.

Представим условную систему с двумя деталями замка. Обычный скрининг проверяет, прилипает ли кандидат к одной детали. FIND показывает, помог ли он двум деталям состыковаться или, наоборот, помешал этому. Такой результат говорит об эффекте на конкретную пару белков, но ещё не доказывает, что молекула станет лекарством и подействует в организме.

Помимо соединений для PPAR-гамма, FIND обнаружила нанотело, которое меняло взаимодействие спайкового белка SARS-CoV-2 с рецептором на человеческих клетках. В контрольной смеси исследователи также нашли известный активатор бета-2-адренергического рецептора. Так они проверили, может ли метод вернуть заранее добавленное соединение. Названия и химические структуры новых малых молекул, а также последовательность нанотела источник не приводит. Результаты пока ограничены лабораторными системами и клеточной культурой: клинических испытаний, эффективности у людей и одобрения препаратов не описано.

Источник не раскрывает названия и химические структуры новых малых молекул, а также последовательность нанотела. Результаты ограничены проверками в клеточной культуре и лабораторными системами: клинических испытаний, эффективности у людей или одобрения препаратов в публикации не описано. Найденные молекулы пока остаются отправными точками для разработки лекарств или исследовательскими инструментами. Подготовить обзор таких результатов можно, например, с помощью услуг по подготовке научных статей.

Схема показывает, как FIND связывает молекулу-кандидата с ДНК-штрихкодом, фиксирует образование петли при взаимодействии белков и определяет соединение по секвенированию штрихкода.

Фото: Google DeepMind / Pexels