14 октября исследователи Университета Райса в США сообщили, что модифицированный фермент Cas13a обнаруживал РНК в лабораторном анализе в 100 раз чувствительнее исходного и при этом не терял стабильности. Испытание провели на синтетической неинфекционной РНК ВИЧ. На пациентах новую версию фермента не проверяли.

Как фермент распознаёт вирусную РНК

Cas13a распознаёт РНК, а не ДНК. В диагностическом анализе он связывается с заданной последовательностью РНК и запускает измеримый сигнал. Чтобы повысить чувствительность и сохранить устойчивость фермента в жёстких условиях, команда сначала определила его структуру, а затем изменила два выбранных участка.

Изменение сразу двух участков оказалось чрезмерным: фермент подавал сигнал и без целевой РНК. После изменения только одного участка чувствительность выросла в 100 раз, а стабильность не снизилась. В сообщении не приводятся точные температурные условия испытаний и исходный предел обнаружения.

Это можно сравнить с настройкой датчика: слишком высокая чувствительность заставит его срабатывать и без искомого объекта. Нужно, чтобы он замечал малое количество цели, но не подавал сигнал, когда её нет. Это условный пример, а не описание отдельного эксперимента.

В лабораторном анализе использовали синтетическую неинфекционную РНК ВИЧ. По мнению авторов, направляющую молекулу, которая указывает Cas13a нужную последовательность, можно перенастроить для распознавания других вирусов. Фермент потенциально может пригодиться в коммерческих анализах, в том числе в тестах ОТ-кПЦР и бокового потока, но готовой диагностической системы пока нет.

О результате рассказала Phys.org со ссылкой на исследователей Университета Райса. Для подготовки научной статьи важны и описание опыта, и его ограничения: здесь клинические испытания новой версии Cas13a не представлены.

Схема лабораторной модификации Cas13a и сравнение результатов изменения одного и двух участков фермента

Фото: Thirdman / Pexels