В больницах Столичного региона Дании генетически однородная подгруппа устойчивого к ванкомицину энтерококка ST80 преобладала в 2012–2015 годах, но после 2015-го клон стал разнообразнее и пошёл на спад. Опейеми У. Лоуэл и соавторы изучили 334 образца из девяти больниц, собранных с 2012 по 2020 год. Их исследование вышло 18 августа 2026 года в журнале Genome Medicine.

Сначала преобладала одна подгруппа

На подгруппу 1.A пришлось 72% изолятов, собранных в 2012–2015 годах. Её геном оставался относительно стабильным и содержал гены и плазмиды, связанные с устойчивостью к антибиотикам, обменом веществ и приспособлением к кишечнику и больничной среде. Авторы предполагают, что сочетание этих признаков помогло подгруппе распространиться.

В образцах 2016–2020 годов изоляты уже распределялись между несколькими подгруппами. Исследователи выявили рекомбинацию, то есть обмен участками ДНК, а также приобретение и утрату генов и плазмид. Разнообразие выросло, а ST80 стал встречаться реже.

Почему клон ослабел, исследование не устанавливает. Авторы предполагают, что могли сказаться утрата полезных генетических признаков, появление неблагоприятных для бактерии изменений, давление антибиотиков и конкуренция с другими клонами, включая ST203. Эти объяснения остаются возможными причинами, а не доказанным механизмом спада.

Представим, что у команды есть снаряжение, хорошо подходящее для определённых условий. Если часть снаряжения меняется, прежнее преимущество может исчезнуть. Это лишь условная аналогия: бактерии не выбирают стратегию, а исследование не проверяло такой сценарий экспериментально.

Большинство образцов, 83%, исследователи получили при выявлении колонизации: бактерия присутствовала в организме, но это не обязательно означало инфекцию. На образцы, связанные с инфекцией, пришлось 17%. Поэтому работа не позволяет отдельно определить, какие генетические признаки связаны с инвазивной болезнью. Авторы также отмечают слабую связь между датой отбора образцов и генетическими различиями, из-за чего точные сроки эволюционных изменений восстановить ненадёжно.

Результаты относятся к одному клону в больницах одного региона Дании. Их нельзя автоматически переносить на другие бактерии или медицинские учреждения. О подготовке и доработке публикаций можно узнать на странице услуг по работе с научными статьями.

Схема показывает смену преобладающей подгруппы ST80 и рост генетического разнообразия в датских больницах; она не изображает эксперимент и не устанавливает причину спада.

Фото: Edward Jenner / Pexels